科研進(jìn)展
西北高原所在牦牛遠(yuǎn)緣雜交后代雄性不育候選基因鑒定方面獲得新進(jìn)展
生殖隔離阻斷或減少了物種間的基因交流,對維持物種完整性至關(guān)重要。犏牛是牦牛(Bos grunniens)和普通牛(Bos taurus)的雜交后代,表現(xiàn)為雌性可育而雄性不育。作為研究家畜不完全生殖隔離的良好模型,犏牛受到了繁殖生物學(xué)領(lǐng)域的廣泛關(guān)注,但導(dǎo)致其精子發(fā)生阻斷的關(guān)鍵機制依然不明確。Dobzhansky-Muller 模型認(rèn)為,雜交致死或不育是由不同基因位點的不相容所造成的?;蚪M結(jié)構(gòu)變異(Genomic structural variation, SV)是遺傳多樣性最重要的來源之一,包括缺失、重復(fù)、插入、易位和倒位等。SV可通過改變基因表達(dá)或抑制減數(shù)分裂重組,直接導(dǎo)致雜交動物生殖細(xì)胞發(fā)育阻斷。目前,親本間SV對犏牛雄性不育的影響在很大程度上仍不明確,遺傳不相容與犏牛生精細(xì)胞基因表達(dá)失調(diào)之間的關(guān)系也尚未得到全面解析。
中國科學(xué)院西北高原生物研究所動物生態(tài)與資源保護(hù)研究團(tuán)隊通過整合牦牛和普通?;蚪MSV位點信息和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),對牦牛、犏牛和回交一代(BC1)睪丸組織在幾個關(guān)鍵發(fā)育階段的組織學(xué)特征、轉(zhuǎn)錄組圖譜以及SV在差異表達(dá)基因(DEGs)中的分布進(jìn)行了表征。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在犏牛睪丸組織中,與精原細(xì)胞命運決定、減數(shù)分裂重組和DSB修復(fù)等過程相關(guān)的基因表達(dá)下調(diào),且在每個發(fā)育階段犏牛中均有一定比例的DEGs含有SV。比如,3月齡犏牛27.78%的DEGs(50/180)中分布有180個SV,其中大部分SV(147/180)位于內(nèi)含子區(qū);10月齡犏牛27.73%的DEGs(1750/6310)中分布有8741個SV,其中大部分SV位于內(nèi)含子區(qū)(7640/8741),少量的SV位于外顯子區(qū)(50/8741)和UTR區(qū)(18/8741)等,這些SV可能會影響基因的表達(dá)。對其中的候選基因ESCO2和BRDT進(jìn)行了表達(dá)驗證,發(fā)現(xiàn)ESCO2在牦牛和犏牛精母細(xì)胞細(xì)線期表達(dá),BRDT在牦牛精母細(xì)胞偶線期和粗線期表達(dá),但在犏牛中只在偶線期表達(dá)。相較于牦牛,犏牛中ESCO2和BRDT的表達(dá)均下調(diào)。此外,還發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的X連鎖基因在10月齡(123/252)和成年(206/274)的犏牛中多數(shù)表達(dá)上調(diào),這可能與減數(shù)分裂性染色體失活(MSCI)異常有關(guān),凸顯了 X 染色體在雜交不育中的作用。然而,相較于犏牛無法產(chǎn)生精子,BC1曲細(xì)精管中出現(xiàn)了少量的圓形精子,并且與精子形成相關(guān)的基因(TSSK6, TSKS, TBC1D21, TPPP2, SPPL2C等)表達(dá)上調(diào),但仍低于牦牛正常精子發(fā)生水平,表明精子發(fā)生缺陷和基因表達(dá)異常在BC1中得到了部分恢復(fù)。本研究獲得了牦牛和犏牛在關(guān)鍵發(fā)育階段的DEGs 和SV位點信息,為了解SV在犏牛雄性不育以及物種雜交不育中的潛在功能提供了啟示。
相關(guān)研究結(jié)果以 Identification of Candidate Genes Related to Hybrid Sterility by Genomic Structural Variation and Transcriptome Analyses in Cattle-yak 為題,于10月15日在 Journal of Dairy Science(農(nóng)林科學(xué)1區(qū)TOP期刊)在線發(fā)表。西北高原所博士研究生萬瑞東為論文第一作者,楊其恩研究員為通訊作者。該工作得到了國家重點研發(fā)計劃 (2021YFD1200405、2021YFD1600201),國家自然科學(xué)基金(31972574、U22A20447)、青海省重大科技專項(2021-NK-A5)等項目的資助。
論文鏈接:https://www.journalofdairyscience.org/article/S0022-0302(24)01212-8/fulltext
文章模式圖