菊科（Asteraceae）亞菊屬（Ajania Poljakov）主要分布在亞洲的荒漠和半荒漠區(qū)域，是重要的經(jīng)濟(jì)植物和觀賞植物。該屬的分類一直以來存在爭(zhēng)議，其內(nèi)部系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系尚未得到很好的解決。中國(guó)科學(xué)院西北高原生物研青藏高原植物適應(yīng)與進(jìn)化研究團(tuán)隊(duì)利用質(zhì)體基因組和轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列重建亞菊屬及其近緣類群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，應(yīng)用多種數(shù)據(jù)集驗(yàn)證了亞菊屬和櫟葉亞菊屬(Phaeostigma Muldashev)的分類修訂。亞菊屬內(nèi)主要譜系存在從草本向半灌木適應(yīng)性演化的趨勢(shì)，可能與其在東亞內(nèi)擴(kuò)散路線及多樣化相關(guān)。櫟葉亞菊屬和百花蒿屬（Stilpnolepis Krasch.）在物種形成早期存在質(zhì)體捕獲或二次接觸事件，影響了二者的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系并導(dǎo)致了高度相似的花序特征。亞菊屬質(zhì)體基因組的結(jié)構(gòu)特征可反映物種間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，重復(fù)序列的分布具有明顯的偏好性。該研究結(jié)果為亞菊屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系提供了新的見解，并指出亞菊屬及其近緣類群仍需要進(jìn)行分類修訂。

研究結(jié)果以?Structural divergence and phylogenetic relationships of Ajania (Asteraceae) from plastomes and ETS?為題發(fā)表在?BMC Genomics?上。西北高原所博士研究生余靜雅為論文第一作者，張發(fā)起研究員為通訊作者。

論文鏈接：https://doi.org/10.1186/s12864-023-09716-4

亞菊屬及其近緣類群系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

亞菊屬及其近緣類群系統(tǒng)發(fā)育不一致示意圖